MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 7206

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017167	CGG	3	9	1903449	1903457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_017167	TCCTA	2	10	1903480	1903489	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4503	NC_017167	GCC	3	9	1903493	1903501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4504	NC_017167	TCG	2	6	1905370	1905375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_017167	GAC	2	6	1905447	1905452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_017167	GGT	2	6	1905456	1905461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_017167	CTCC	2	8	1905953	1905960	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4508	NC_017167	CCG	2	6	1905988	1905993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4509	NC_017167	CCTC	2	8	1906288	1906295	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4510	NC_017167	GAT	2	6	1906310	1906315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_017167	A	7	7	1906462	1906468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_017167	GCC	2	6	1906469	1906474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_017167	GGC	2	6	1906484	1906489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_017167	TCA	2	6	1906721	1906726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_017167	CA	3	6	1906737	1906742	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4516	NC_017167	CGC	2	6	1906750	1906755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4517	NC_017167	ACG	2	6	1906760	1906765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_017167	TGT	2	6	1906778	1906783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_017167	AG	3	6	1906868	1906873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_017167	GAG	2	6	1906896	1906901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_017167	CG	3	6	1907672	1907677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4522	NC_017167	CGA	2	6	1908366	1908371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_017167	GAT	2	6	1908457	1908462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_017167	AGG	2	6	1908470	1908475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_017167	AGGG	2	8	1908660	1908667	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_017167	CTCC	2	8	1908685	1908692	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4527	NC_017167	GA	3	6	1909541	1909546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_017167	CCAA	2	8	1909564	1909571	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_017167	TGC	2	6	1909580	1909585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_017167	TGCT	2	8	1909629	1909636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4531	NC_017167	TTA	2	6	1909644	1909649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_017167	AAC	2	6	1909696	1909701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_017167	ATG	2	6	1909729	1909734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_017167	CG	3	6	1909750	1909755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4535	NC_017167	CCAT	2	8	1914024	1914031	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4536	NC_017167	TATC	2	8	1915985	1915992	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4537	NC_017167	TCT	2	6	1917144	1917149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_017167	AG	3	6	1917155	1917160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_017167	TCC	2	6	1918743	1918748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4540	NC_017167	CG	3	6	1918794	1918799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4541	NC_017167	CGG	2	6	1918843	1918848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_017167	CAG	2	6	1918888	1918893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_017167	GTA	2	6	1918894	1918899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4545	NC_017167	CTT	2	6	1919041	1919046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4547	NC_017167	CT	3	6	1919135	1919140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4548	NC_017167	GCG	2	6	1919162	1919167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_017167	CCG	2	6	1919175	1919180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4550	NC_017167	GA	3	6	1919223	1919228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_017167	GGGC	2	8	1919294	1919301	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4552	NC_017167	C	6	6	1924723	1924728	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4556	NC_017167	TC	3	6	1925741	1925746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4557	NC_017167	TCGG	2	8	1925760	1925767	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4558	NC_017167	CT	3	6	1925803	1925808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4559	NC_017167	TG	3	6	1925809	1925814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_017167	GCC	2	6	1925840	1925845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4561	NC_017167	TGG	2	6	1925854	1925859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_017167	CCT	2	6	1931096	1931101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4563	NC_017167	GGT	2	6	1931109	1931114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_017167	CGT	2	6	1931119	1931124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4581	NC_017167	CG	3	6	1935388	1935393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4593	NC_017167	C	6	6	1945069	1945074	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4601	NC_017167	A	6	6	1951263	1951268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4606	NC_017167	CG	4	8	1957113	1957120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4607	NC_017167	CA	3	6	1957390	1957395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4608	NC_017167	AC	3	6	1957405	1957410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4609	NC_017167	A	7	7	1957419	1957425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4615	NC_017167	CG	3	6	1958020	1958025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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